近日，深圳承啟生物科技有限公司利用自主研發(fā)的云平臺Chi-Cloud及高精度算法FANSe3，實現(xiàn)了單機5分鐘分析完成一個全基因組數(shù)據(jù)集。這使得基因檢測結(jié)果向“立等可取”、“又快又準(zhǔn)”邁進(jìn)了一大步，大力推進(jìn)了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的普及落地。
承啟生物團隊拋開傳統(tǒng)算法的框架，自主研發(fā)了底層算法FANSe系列算法，這是目前國內(nèi)唯一規(guī)?；逃玫娜灾髦R產(chǎn)權(quán)的高性能測序比對算法，其準(zhǔn)確度在各種實測中大幅度領(lǐng)先國外算法。2017年，承啟生物基于FANSe3開發(fā)的新一代私有云平臺Chi-Cloud，就實現(xiàn)了全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的秒級分析，并發(fā)表在英國著名的權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《核酸研究》上。2018年，承啟生物更是創(chuàng)下了“1分鐘解碼2萬個基因信息（全外顯子組）”的世界紀(jì)錄。
更值得一提的是，達(dá)到這個速度，承啟生物并沒有動用大型服務(wù)器，只是使用了一臺高端的家用電腦。所有運算只使用CPU，無需任何GPU、FPGA等專用硬件加速。這意味著基因組測序基礎(chǔ)分析的成本已達(dá)到了幾乎忽略不計的程度。在對數(shù)據(jù)保密性有高要求的一些特殊領(lǐng)域（如軍事、公共安全、特定的醫(yī)療場景等），可直接采用這種單機分析的方式，而無需采購和維護(hù)大型計算集群，無需連接到互聯(lián)網(wǎng)。自主研發(fā)、不依賴專用硬件的特性使得各種功能增加與改進(jìn)十分方便，可擴展性強，且不會受制于特定硬件平臺，從根本上避免了芯片禁運導(dǎo)致的風(fēng)險。同時，該云平臺兼容目前國內(nèi)外所有主流測序儀，并針對國產(chǎn)測序儀進(jìn)行了特別適配和優(yōu)化，有力地保障了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的國家安全。
超高速、低成本的分析及更精確的結(jié)果解讀，基因檢測即將迎來立等可取的廣泛應(yīng)用場景，也將對整個行業(yè)的發(fā)展提供有力支撐。對研究人員而言，可更高效地分析基因組數(shù)據(jù)，大力推動精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)和疾病治療等領(lǐng)域加速發(fā)展。對百姓而言，以前緩慢昂貴的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)檢測將變得更快速、實惠，診斷和治療將更有效、便宜；尤其是情況危急的病患，快速準(zhǔn)確的基因組分析能在第一時間幫助醫(yī)生快速診斷和制定最佳治療方案，將拯救更多生命。
（美通社,2020年6月18日深圳）
